cgminer -c cgminer.conf

Существует целая cgminer нить здесь:
Информация, которую вы искать тут же, на первой странице.

Есть ли повод для вашего не имея знакомились с файлом README? Он содержит некоторые очень полезные лакомые кусочки информации и упаковывается с cgminer.
После того, как вы ознакомились с ним, переходите к examples.conf, который содержит пример конфигурации.
Измените его в соответствии с вашими потребностями, сохранить под другим именем, используя нагрузку -c параметр при вызове cgminer.

Остерегайтесь опечаток в файле конфигурации. Cgminer просто прекращается, если он не может разобрать его.
Я понимаю, что JSON является общей болью для редактирования вручную, но вы будете делать это только один раз.

Кроме того, вы можете нажать кнопку S (как в настройках) в главном экране вашего настроенного cgminer, то W (как в записи файла конфигурации), введите имя файла и есть ваша конфигурация.