Если SWF содержит видео: ffmpeg.exe -i "source.swf" "animation.gif"
Конечно, вы можете использовать все FFmpeg варианты, такие как изменение размера и т.д.

Если это не удается, вы всегда можете использовать рекордер экрана, чтобы сохранить анимацию и обработать его с помощью FFmpeg после этого.